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利用光控核定位技术对酵母基因表达进行光遗传学抑制

DOI:10.1007/s12195-019-00598-9 期刊:Cellular and Molecular Bioengineering 出版年份:2019 更新时间:2025-09-12 10:27:22
摘要: 引言——控制基因表达是基础生物学与合成生物学的核心目标,因其能揭示细胞功能并调控细胞活动。我们探索了在模式生物酿酒酵母中构建光遗传学基因表达抑制系统的可能性,通过光信号调控无核酸酶活性的Cas9蛋白(dCas9)的核定位来实现这一目标。 方法——当dCas9蛋白在适宜引导RNA(sgRNA)存在下定位于细胞核时,可作为目标基因的抑制因子。我们将dCas9蛋白、哺乳动物转录抑制因子Mxi1以及光遗传学核定位调控工具(LINuS)整合至现有酵母光遗传学工具包中。这使得含有新型dCas9抑制构型与引导RNA的表达盒能快速构建并整合至酵母基因组。 结果——我们的抑制因子库在不依赖诱导剂或启动子改造的情况下展现出多样化的基础抑制水平。含这些抑制因子的细胞群体可组合形成表达量差异达100倍的酵母异质群体。研究发现抑制效果可通过光剂量与强度进行适度调控。利用该库我们抑制了羊毛甾醇14α-去甲基化酶Erg11的表达,从而获得对重要抗真菌药物氟康唑具有梯度敏感性的酵母菌株。 结论——该工具包将有效助力酿酒酵母基因表达的时空精准调控。此外,我们认为该方案的简洁性便于对这些抑制因子进行改造,从而控制致病酵母等医学相关真菌的基因表达。
作者: Stephanie H. Geller,Enoch B. Antwi,Barbara Di Ventura,Megan N. McClean
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研究概述 实验方案 设备清单

探索通过光控核酸酶失活的Cas9(dCas9)核定位,在酿酒酵母中生成基因表达光遗传学抑制因子的可能性。

所开发的工具包可用于酿酒酵母中基因表达的时空扰动。该方案的简便性使得这些阻遏蛋白能够被轻松改造,从而控制医学相关真菌(如致病酵母)的基因表达。

所实现的光诱导抑制效果相对较弱(最高达2倍)。基础抑制作用以及现有Tef1-GFP蛋白的稀释时间,导致了这种较低水平的光诱导抑制。

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