研究目的
通过开发支持SBOL 2.0标准的libSBOLj 2.0 Java库，提高合成生物学设计的可复现性及其在研究人员和/或基因设计自动化工具之间的电子交换能力。
研究成果
libSBOLj 2.0库为合成生物学设计编码与交换管理提供API、文档及附加工具，支持SBOL 2.0标准。该库能以层级化方式同时规范结构与功能，提升合成生物系统的可复现性与可重用性。
研究不足
该论文未明确提及研究的局限性或libSBOLj 2.0库的局限性。
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[2018年IEEE第八届纳米材料：应用与特性国际会议(NAP) - 乌克兰扎托卡(2018.9.9-2018.9.14)] 2018年IEEE第八届纳米材料：应用与特性国际会议(NAP) - 离子注入硒超掺杂硅后接脉冲激光退火处理
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[2018年IEEE第八届纳米材料：应用与特性国际会议(NAP) - 乌克兰扎托卡(2018.9.9-2018.9.14)] 2018年IEEE第八届纳米材料：应用与特性国际会议(NAP) - 离子注入硒超掺杂硅后接脉冲激光退火处理
DOI：10.1109/nap.2018.8915262
出版年份：2018
更新时间：2025-09-19 17:13:59
摘要：
合成生物学开放语言（SBOL）是一种用于表示合成生物学设计的新兴数据标准。该标准的目的是提高这些设计的可重复性，并促进研究人员和/或基因设计自动化工具之间的电子交换。最新版本的标准SBOL 2.0能够对多种生物组件（如DNA、RNA、蛋白质、复合物、小分子等）及其相互作用进行注释。SBOL 2.0还允许研究人员将组件组织成层次化?？?，指定其预期功能，并将?？橛朊枋銎涫形哪Ｐ拖喙亓?。为了支持SBOL 2.0的使用，我们开发了libSBOLj 2.0 Java库，该库为开发人员提供了一个易于使用的应用程序编程接口（API），包括对SBOL构造的操作、与RDF/XML文件格式之间的序列化，以及通过将先前的SBOL 1.1标准转换为SBOL 2.0来提供迁移支持。本信函描述了libSBOLj 2.0库及其设计中涉及的关键工程决策。
作者：
ZHEN ZHANG，TRAMY NGUYEN，NICHOLAS ROEHNER，G?KSEL MISIRLI，MATTHEW POCOCK，ERNST OBERORTNER，MEHER SAMINENI，ZACH ZUNDEL，JACOB BEAL，KEVIN CLANCY，ANIL WIPAT，CHRIS J. MYERS
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