研究目的
通过开发支持SBOL 2.0标准的libSBOLj 2.0 Java库，提高合成生物学设计的可重复性及其在研究人员和/或基因设计自动化工具之间的电子交换能力。
研究成果
libSBOLj 2.0 Java库提供了用于管理合成生物学设计编码与交换的API、文档及附加工具，支持SBOL 2.0标准。该库在SBOL 1.1基础上进行扩展，以分层方式同时定义结构与功能，从而实现对多种生物组件及其相互作用的标注。
研究不足
该论文未明确提及研究的局限性或libSBOLj 2.0库的局限性。
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[IEEE 2019年第16届中国国际固态照明论坛暨2019年国际宽带隙半导体论坛（中国）（SSLChina: IFWS） - 中国深圳（2019.11.25-2019.11.27）] 2019年第16届中国国际固态照明论坛暨2019年国际宽带隙半导体论坛（中国）（SSLChina: IFWS） - 大功率荧光粉转换发光二极管综述
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DOI：10.1109/SSLChinaIFWS49075.2019.9019776
出版年份：2019
更新时间：2025-09-23 15:19:57
摘要：
合成生物学开放语言（SBOL）是一种用于表示合成生物学设计的新兴数据标准。该标准的目的是提高这些设计的可重复性，并促进研究人员和/或基因设计自动化工具之间的电子交换。最新版本的标准SBOL 2.0能够对多种生物组件（如DNA、RNA、蛋白质、复合物、小分子等）及其相互作用进行注释。SBOL 2.0还允许研究人员将组件组织成层次化?？?，指定其预期功能，并将?？橛朊枋銎涫形哪Ｐ拖喙亓Ｎ酥С諷BOL 2.0的使用，我们开发了libSBOLj 2.0 Java库，该库为开发者提供了一个易于使用的应用程序编程接口（API），包括操作SBOL构造、与RDF/XML文件格式的序列化和反序列化，以及通过将先前的SBOL 1.1标准转换为SBOL 2.0提供迁移支持。本信函描述了libSBOLj 2.0库及其设计中涉及的关键工程决策。
作者：
ZHEN ZHANG，TRAMY NGUYEN，NICHOLAS ROEHNER，G?KSEL MISIRLI，MATTHEW POCOCK，ERNST OBERORTNER，MEHER SAMINENI，ZACH ZUNDEL，JACOB BEAL，KEVIN CLANCY，ANIL WIPAT，CHRIS J. MYERS
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