研究目的
为了表征和改造光激活腺苷酸环化酶(PACs),以实现对光遗传学中环核苷酸信号传导的精确时空控制。
研究成果
开发的测试平台能高效表征并优化光激活通道蛋白(PACs),从而设计出具有改良光响应特性的变体(例如降低远红光敏感性的DdPAC)。这些工具增强了用于研究环核苷酸信号传导的光遗传学应用。
研究不足
该报告基因检测提供的是PAC活性随时间的间接综合测量值,而非急性活性;其结果受细胞环境及内源性酶(如CpdA)影响;无法直接测定特定酶活性;且仅适用于可在大肠杆菌中表达的PACs。
1:实验设计与方法选择:
设计了一种细菌报告基因检测系统,通过大肠杆菌中cAMP依赖的荧光报告基因(DsRed)表达来监测PAC活性。采用可编程LED照明系统进行可控光照。
2:样本选择与数据来源:
使用大肠杆菌菌株CmpX13 ΔcyaA,携带表达PAC变体(如bPAC、PaaC、DdPAC)的质粒及报告质粒pCyclR。
3:实验设备与材料清单:
微孔板、LED矩阵(含470、525、620 nm或655和850 nm LED)、酶标仪(Tecan Infinite M200 PRO)、HPLC系统(Waters Acquity UPLC)、功率计(Newport 842-PE)及多种生化试剂(如L-阿拉伯糖、IPTG、抗生素)。
4:620 nm或655和850 nm LED)、酶标仪(Tecan Infinite M200 PRO)、HPLC系统(Waters Acquity UPLC)、功率计(Newport 842-PE)及多种生化试剂(如L-阿拉伯糖、IPTG、抗生素)。 实验流程与操作步骤:
4. 实验流程与操作步骤:细菌培养于微孔板中,经L-阿拉伯糖或IPTG诱导后,施加特定光照方案,孵育后测定荧光强度/OD600值。对纯化蛋白采用HPLC检测cAMP产量。
5:数据分析方法:
荧光数据经光密度值标准化后用Fit-o-mat软件分析;HPLC数据通过Waters Empower软件积分;统计学分析包含生物学重复的平均值±标准差。
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LED
WP908A8SRD
Kingbright
Illumination for light activation of photoreceptors
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LED
HE1-120AC-XXXX
Harvatek
Illumination for light activation of photoreceptors
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Power Meter
842-PE
Newport
Calibration of light intensities
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Photodetector
918D-UV-OD3
Newport
Detection of light for calibration
-
Plate Reader
Infinite M200 PRO
Tecan
Measurement of fluorescence and optical density
-
HPLC System
Acquity UPLC
Waters
Quantification of cAMP and ATP
-
Column
Kinetex 5u EVO C18
Waters
Reverse-phase chromatography for cAMP analysis
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Arduino Board
Uno
Arduino
Control of LED matrix for programmable illumination
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LED Driver Shield
ITEAD Full Color RGB LED Matrix Driver Shield
Itead
Driving LEDs in the illumination matrix
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