研究目的
通过改进有序子集期望最大化重建算法,在光学投影断层扫描(OPT)中减少纵向活体模型研究中的总采集时间和样品光照剂量。
研究成果
改进的OSEM重建算法在OPT中显著减少了投影数量和采集时间,同时保持了与使用更多投影的FBP相当的图像质量。采用DBP的预校准方法有效避免了后校准需求,加快了重建过程。该方法通过最小化光毒性和其他负面影响,有利于纵向活体研究。
研究不足
该方法可能受限于特定的生物模型(斑马鱼)以及为减少光学散射所需的预处理要求。尽管引入了预校准,但校准过程可能仍需手动调整。在极低投影场景下,噪声和伪影可能会影响算法的性能。
1:实验设计与方法选择:
本研究为光学投影断层扫描(OPT)设计了一种改进的有序子集期望最大化(OSEM)重建算法,以减少投影数量和采集时间。提出采用直接反投影(DBP)算法的预校准方法,在数据采集前对成像系统进行校准。
2:样本选择与数据来源:
以斑马鱼标本作为生物模型,通过甲醇及苯甲醇苯甲酸苄酯(BABB)混合液浸泡预处理以降低光学散射。
3:实验设备与材料清单:
实验装置包含具有明场与荧光照明??榈乃L琌PT系统、白光LED、漫射器、特定波长激光器(配扩束镜与准直器)、旋转载物台、物镜、光阑、发射滤光片、管镜及高灵敏度CCD相机。标本固定于充满BABB的透明管中。
4:实验流程与操作步骤:
标本分步旋转,分别采集透射模式与荧光模式的投影图像。透射OPT(tOPT)采用白光照明;发射OPT(eOPT)使用550纳米激光激发罗丹明B染色的荧光团。在360度范围内以不同角度步长采集图像。预处理包括光照不均匀性校正与图像尺寸调整,采用OSEM算法通过迭代更新实现重建。
5:数据分析方法:
使用结构相似性指数(SSIM)评估图像质量,对比OSEM与滤波反投影(FBP)算法的重建图像。统计分析包括计算不同投影子集与迭代次数的SSIM值及方差。
独家科研数据包,助您复现前沿成果,加速创新突破
获取完整内容-
CCD camera
Capturing projection images from different views in the OPT system.
-
LED
Providing bright-field illumination for transmission OPT mode.
-
Laser
Exciting fluorophores in the specimen for emission OPT mode.
-
Rotation stage
Actuating the specimen step by step for acquiring projections at different angles.
-
Emission filter
Separating fluorescent light from incident illumination in eOPT mode.
-
登录查看剩余3件设备及参数对照表
查看全部