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[分子生物学方法] 植物长链非编码RNA 第1933卷(方法与实验方案)|| 用于可视化植物中RNA-蛋白质相互作用的三元荧光互补(TriFC)检测法

DOI:10.1007/978-1-4939-9045-0_19 出版年份:2019 更新时间:2025-11-21 11:08:12
摘要: RNA-蛋白质相互作用在多种真核生物过程中发挥重要作用。对植物中RNA-蛋白质复合体亚细胞定位的分子成像对于理解这些相互作用至关重要。然而,迄今为止尚未开发出活体植物中RNA-蛋白质相互作用的成像方法。最近,我们通过烟草叶片瞬时表达建立了一个三分子荧光互补(TriFC)系统,用于活体观察RNA-蛋白质相互作用。该方法将传统的双分子荧光互补(BiFC)系统与MS2系统(噬菌体MS2衣壳蛋白[MCP]及其结合RNA序列[MS2序列])相结合来标记长链非编码RNA。目标RNA被6xMS2标记,MCP和RNA结合蛋白则与YFP片段融合。将这些融合RNA和蛋白的DNA构建体通过农杆菌悬浮液浸润到烟草叶片中,通过共聚焦显微镜观察活体RNA-蛋白质相互作用。
作者: Jun Sung Seo,Nam-Hai Chua
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研究概述 实验方案 设备清单

为了开发一种三分子荧光互补(TriFC)系统,用于在植物体内可视化RNA-蛋白质相互作用,因为在此之前尚未有方法能在活体植物中成像RNA-蛋白质相互作用。

TriFC检测法成功实现了植物体内RNA-蛋白质相互作用的可视化,为研究长链非编码RNA功能提供了新工具。该方法结合双分子荧光互补(BiFC)和MS2系统,通过YFP互补来检测相互作用,并以ELENA1和MED19a进行了验证。该技术能揭示RNA-蛋白质复合体的亚细胞定位与动态变化,在植物生物学领域具有更广泛的应用潜力。

转录后基因沉默(PTGS)可能降低效率,可通过与pUBQ:p19共浸润来缓解。若未检测到信号,可能需要测试6xMS2标签和YFP片段方向的最佳组合。该方法为瞬时表达,可能无法反映稳定相互作用。

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