研究目的
研究一种四角形DNA折纸/金纳米粒子混合结构在不同介质中与特定DNA靶标相互作用时改变构型的读出鲁棒性。
研究成果
设计的3ss四面体DNA折纸结构展现出在不同环境中维持目标杂交诱导的结构修饰的能力,凸显了其在分子识别和诊断应用中的潜力。该研究强调了该结构对环境影响的稳健性,为其在各种生物医学应用中的使用铺平了道路。
研究不足
该研究承认水溶液中的热涨落会影响DNA折纸结构的柔韧性,且某些测量中聚集效应可能主导信号。
1:实验设计与方法选择:
本研究设计了一种四角DNA折纸等离子体传感器,通过金纳米颗粒(AuNP)探究其对不同环境中特定DNA靶标的响应。研究方法包括采用小角X射线散射(SAXS)、光学消光测量和扫描电子显微镜(SEM)进行分析。
2:样本选择与数据来源:
样本包含修饰有AuNP的DNA折纸结构,在水溶液、固体载体和粘性凝胶中进行分析。
3:实验设备与材料清单:
所用设备包括用于SAXS的Pilatus 1M探测器、耦合光谱仪的倒置光学显微镜(用于LSPR测量),以及场发射枪蔡司Supra 40扫描电子显微镜(用于SEM成像)。
4:实验流程与操作步骤:
合成DNA折纸结构后进行AuNP功能化处理,随后在不同介质中分析其对DNA靶标杂交的响应。
5:数据分析方法:
数据分析采用Fit2D进行SAXS数据转换,Mie理论处理LSPR测量数据,SmartSEM?软件分析SEM图像。
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获取完整内容-
Leica EM GP
EM GP
Leica
Used for plunge-freezing of the cryo-EM grids.
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Zeiss Libra 120 transmission electron microscope
Libra 120
Carl Zeiss SMT GmbH
Used for imaging under low-dose condition.
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Axiovert 200
200
Zeiss
Inverted optical microscope used for LSPR measurements.
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Supra Zeiss 40 scanning electron microscope
Supra 40
Zeiss
Used for SEM imaging of the DNA origami structures.
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JEM 2100f UHR transmission electron microscope
2100f UHR
JEOL
Used for TEM imaging of the samples.
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Pilatus 1M detector
1M
Dectris
Used for collecting SAXS data in a q-range from 0.058 to 5 nm?1.
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JPK Nanowizard II
Nanowizard II
JPK
Used for AFM analysis in air in contact mode.
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Shamrock SR-750 spectrometer
SR-750
Andor Technology plc.
Coupled with the microscope for LSPR measurements.
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Newton DU971-UVB EMCCD
DU971-UVB
Andor Technology plc.
Used for analyzing the light transmitted through the sample.
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