研究目的
研究偏振激发-发射矩阵(pEEM)测量与平行因子(PARAFAC)分析在天然状态兔免疫球蛋白G(rIgG)本征荧光光谱(IFS)中的应用,重点通过各向异性与化学计量学方法解决光谱重叠问题并解析发射组分。
研究成果
PARAFAC解析出一个主要成分,代表从Tyr到Trp的异质FRET,以及一个次要成分来自直接激发的Trp发射。在温度范围内观察到最小的结构变化,荧光变化主要由热猝灭引起。该研究为未来使用ARMES和PARAFAC研究IgG变性和聚集建立了基线。
研究不足
该研究受限于FRET导致的蛋白质IFS非线性效应(无法完全校正)。瑞利散射残余噪声影响各向异性值及PARAFAC建模。所设温度范围引发的结构变化微小,限制了组分解析度。插值法可能引入畸变,且IgG中大量荧光团增加了光谱区分难度。
1:实验设计与方法选择:
本研究采用偏振激发-发射矩阵(pEEM)光谱结合PARAFAC分析解析rIgG中的荧光组分。评估了数据预处理方法以校正内滤效应、瑞利和拉曼散射,并通过插值去除噪声。
2:样本选择与数据来源:
使用血清来源的兔IgG,配制于pH 6.5的磷酸盐缓冲盐水(PBS)中。制备三份平行溶液,过滤后冷冻保存待测。
3:5的磷酸盐缓冲盐水(PBS)中。制备三份平行溶液,过滤后冷冻保存待测。 实验设备与材料清单:
3. 实验设备与材料清单:设备包括Cary 60紫外-可见分光光度计、配备双线栅偏振器的Cary Eclipse荧光仪、温控多孔样品架及石英比色皿。材料包含兔IgG、PBS缓冲组分及滤膜。
4:实验流程与操作步骤:
在15-35°C温度范围内采集四种偏振设置的pEEM光谱。数据处理流程依次包括空白扣除、散射消除、内滤效应校正、插值和平滑化。
5:数据分析方法:
使用PLS_Toolbox和MATLAB进行PARAFAC分析,方法包含归一化、非负约束,并通过半分割验证和CONCORDIA检验进行验证。
独家科研数据包,助您复现前沿成果,加速创新突破
获取完整内容-
Cary 60
Cary 60
Agilent
UV-Vis absorbance spectra collection
Cary 60 UV-Vis Spectrophotometer
立即获取同款设备 -
Cary Eclipse
Cary Eclipse
Agilent
Fluorimeter for EEM and ARMES measurements
-
Polyethersulfone Filters
Captiva Premium Syringe filters
Agilent
Membrane filtration of samples
暂无现货
预约到货通知
-
Wire Grid Polarizers
Bespoke dual wire grid polarizers
Polarization of light for anisotropy measurements
暂无现货
预约到货通知
-
Temperature-Regulated Multi-Cell Holder
Temperature control during measurements
暂无现货
预约到货通知
-
Quartz Cuvettes
10 x 2 mm pathlength
Lightpath Optical
Holding samples for spectroscopic measurements
暂无现货
预约到货通知
-
Lobind Tubes
1.5 mL
Eppendorf
Storage of sample aliquots
暂无现货
预约到货通知
-
PLS_Toolbox
ver. 8.2.1
Eigenvector Research Inc.
Chemometric data analysis
暂无现货
预约到货通知
-
MATLAB
ver. 9.1.0
The Mathworks Inc.
Data analysis and programming
暂无现货
预约到货通知
-
FluorS
In-house written program for fluorescence data analysis
暂无现货
预约到货通知
-
登录查看剩余8件设备及参数对照表
查看全部