研究目的
开发一种灵敏且选择性强的纳米传感器,用于定量检测M.SssI CpG甲基转移酶活性,该传感器利用量子点和单分子检测的独特特性。
研究成果
开发的单量子点纳米传感器为M.SssI甲基转移酶活性提供了一种灵敏、选择性且mC阳性的检测方法,在临床诊断和药物发现中具有潜在应用价值。
研究不足
该方法需要特定的DNA底物和酶,其灵敏度可能受到甲基化、切割和延伸步骤效率的影响。
1:实验设计与方法选择:
该纳米传感器基于M.SssI甲基转移酶对特定DNA序列的甲基化作用,随后通过GlaI内切酶切割并由末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)延伸掺入Cy5-dATP。这些产物在链霉亲和素包被的量子点上的组装实现了基于荧光共振能量转移(FRET)的检测。
2:样本选择与数据来源:
使用带有特定甲基化位点的生物素/磷酸修饰双链DNA底物。通过凝胶电泳和荧光光谱分析甲基化及切割产物。
3:实验设备与材料清单:
包括量子点、DNA寡核苷酸、M.SssI甲基转移酶、GlaI内切酶、TdT、Cy5-dATP及其他试剂。
4:实验流程与操作步骤:
过程包含DNA底物的甲基化、GlaI切割、TdT及Cy5-dATP延伸、量子点组装及荧光测量。
5:数据分析方法:
采用荧光强度和单分子计数来量化M.SssI甲基转移酶活性。
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Quantum Dots
605QD
Fluorescence resonance energy transfer (FRET) donor
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Cy5-dATP
Fluorescence resonance energy transfer (FRET) acceptor
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M.SssI CpG methyltransferase
New England Biolabs
Methylation of DNA substrate
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GlaI endonuclease
SibEnzyme Ltd
Cleavage of methylated DNA
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Terminal deoxynucleotidyl transferase
New England Biolabs
Elongation of DNA fragments with Cy5-dATP
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