研究目的
创建一种光依赖性合成核糖开关，其结构变化仅在结合配体的某一种光异构体时发生。
研究成果
该研究成功开发出一种RNA适配体，能高亲和力（KD值为545 nM）选择性结合偶氮氯霉素的反式光异构体，且不与顺式光异构体结合。该体系为工程化光响应性合成核糖开关奠定了基础，为时空精准调控基因表达提供了工具。
研究不足
该研究聚焦于光响应性RNA适配体的开发及其初步表征。要开发出完全功能化的光响应性核糖开关，还需进一步工程化改造。该系统在体内环境的适用性及在细胞环境中的效率仍有待探索。
1：实验设计与方法选择：
本研究涉及光控偶氮苯化合物（azoCm）的合成及其生物物理特性表征。通过体外筛选（SELEX）鉴定RNA适配体，并研究其结合特异性与亲和力。
2：样本选择与数据来源：
合成了配体azoCm并完成表征。为SELEX设计了RNA文库，包含N74随机区域及含预形成茎环结构的较小文库（N64）。
3：实验设备与材料清单：
设备包括紫外-可见分光光度计（Specord S600或S100）、ThorLabs LED灯（M365L2和M420L2）、Jasco J-710圆二色谱仪及MicroCal iTC200/PEAQ iTC200等温滴定量热仪。
4：0）、ThorLabs LED灯（M365L2和M420L2）、Jasco J-710圆二色谱仪及MicroCal iTC200/PEAQ iTC200等温滴定量热仪。 实验流程与操作步骤：
4. 实验流程与操作步骤：SELEX过程包含azoCm在Affi-Gel 10上的固定、RNA文库制备、结合与洗脱步骤及洗脱RNA扩增。引入光洗脱以富集光响应性适配体。
5：数据分析方法：
通过等温滴定量热法测定结合亲和力；圆二色谱监测azoCm光异构化引发的RNA构象变化；深度测序分析特定序列的富集情况。
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