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钌(II)多吡啶配合物[Ru(phen)2dppz-idzo]2+作为RNA三链体poly(U)·poly(A)*poly(U)的比色分子"光开关"及高效稳定剂

DOI:10.1016/j.saa.2018.12.048 期刊:Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy 出版年份:2019 更新时间:2025-09-23 15:23:52
摘要: 本研究采用光谱法和粘度法考察了[Ru(phen)2dppz-idzo]2+(phen=1,10-菲啰啉,dppz-idzo=dppz-咪唑酮)与三链RNA poly(U)?poly(A)*poly(U)的相互作用。荧光滴定表明,该配合物对三链poly(U)?poly(A)*poly(U)的选择性优于poly(U)?poly(A)和poly(U),在后者存在时呈现约123倍的发光增强"光开关"效应。值得注意的是,该"光开关"行为在紫外光照射下甚至肉眼可见。据我们所知,[Ru(bpy)2dppz-idzo]2+是首个能作为三链poly(U)?poly(A)*poly(U)比色分子"光开关"的小分子。结合光谱、粘度数据及该配合物对模板双链poly(U)?poly(A)的稳定作用,我们推测[Ru(phen)2dppz-idzo]2+更倾向于结合三链的Hoogsteen碱基配对链(第三链),因此其插入第三链产生的稳定效应比三链Watson-Crick碱基配对双链更为显著。这些发现有助于理解三链RNA poly(U)?poly(A)*poly(U)与小分子(特别是钌(II)配合物)的相互作用机制。
作者: Yongdeng Feng,Xiaohua Liu,Shuai Ma,Fangfang Wang,Lifeng Tan
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研究概述 实验方案 设备清单

研究[Ru(phen)2dppz-idzo]2+与三链RNA poly(U)?poly(A)*poly(U)的相互作用,以理解其作为比色分子光开关和稳定剂的作用。

复合物[Ru(phen)2dppz-idzo]2+作为三链RNA poly(U)?poly(A)*poly(U)的比色分子光开关,具有高选择性和发射增强特性。它对Hoogsteen碱基配对链的稳定作用优于Watson-Crick双链,表明其优先结合第三条链。该研究为RNA-小分子相互作用(特别是钌(II)配合物)提供了新见解,并显示出在RNA传感与稳定化中的潜在应用价值。

该研究仅限于特定的RNA序列(poly(U)?poly(A)*poly(U)、poly(A)?poly(U)和poly(U)),可能无法推广至其他三链体结构。实验是在受控缓冲液条件下(pH 7.0,20°C)进行的,可能无法完全代表生理环境。结合机制是通过光谱学和粘度数据推断得出的,缺乏直接的结构证据(如X射线晶体学)。

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